- 提高阳性率之——家系（Trios）模式
致病突变的必要条件——家系遗传共分离
如果一个变异是导致某种单基因病的，那么患者一定是以致病方式携带（比如对于常染色体显性遗传病，就是杂合携带，对于常染色体隐性遗传病，就是纯合或复合杂合方式携带），而其没有患病的家族成员（比如其父母）则应该是以非致病方式携带（比如对于常染色体显性遗传病，就是不携带的野生型，而对于常染色体隐性遗传病，就是杂合携带或不携带）。这种在一个家系里，相同表型和基因型的连锁绑定，以及不同表型和基因型的明确区分，被称为遗传学共分离。
遗传学共分离现象为判断变异的致病性提供了重要依据。
家系（Trios）模式为共分离分析提供了可能
传统的遗传病基因检测，由于成本原因，大多是先检测先证者的编码区序列，如果发现了可疑的变异，再用Sanger测序验证其父母是否携带该变异，进而判断是否存在遗传共分离，这可以叫做“单人再验证”模式。
家系（Trios）模式则是一次同时对先证者及其父母进行NGS检测，对先证者的每一个变异都进行三人的平行比对，看是否符合共分离。
非标准（超过三人）的家系模式分析
其实家系检测分析不限于标准家系——患儿加父母一家三口（Trios），非标准家系更好，非标准家系是指在此基础上再增加其他家庭成员，参与检测的家系患者成员越多越好，患病成员涉及代际越多越好，患者的无表型兄弟姐妹越多越好。
家系（Trios）模式的优越性
与传统的先证者检测相比，家系（Trios）模式可以：
降低假阳性率
在数据分析时最头疼的是在患者的数据中，有大量生物学和临床特征似是而非。难以判断致病性的变异，借助家系（Trios）模式，可以干净利索的过滤掉不符合共分离原则的变异，瞬间感觉整个世界都清净了！
提高真阳性率
有些变异可能是生物学和临床特征不那么典型支持致病的，有可能在数据分析时被过滤掉。但是借助家系（Trios）模式，可以筛选出符合共分离原则的变异，尤其是新发（Denovo）变异，这类变异在ACMG标准中可是强烈提示致病的级别！
2014年Lee H在一组800多例临床外显子组测序的研究对比中发现，家系（Trios）策略可以使临床外显子组的阳性率从22%提升至31%，甚至在发育迟缓类患者中，仅测单人的阳性率仅有9%，家系（Trios）模式高达41%！
缩短诊断周期
如果没有家系（Trios）数据，则有大量似是而非的变异需要人工分析，不仅如此，人工分析后还要用Sanger测序法去验证是否符合共分离。这对于全外显子组或全基因组来说，这个工作量是恐怖的，周期也是不确定的，一般会拖延两周以上，而且很有可能白费了半天劲，仍然漏掉了致病突变。但借助家系（Trios）模式，则可一目了然挑选出共分离的变异。
降低检测费用
看到这个说法，不少读者自然会有疑问，家系（Trios）检测三个人，怎么会比检测单人反而降低费用呢？因为如果没有家系（Trios）数据，则有大量似是而非的变异要用Sanger测序法去验证是否符合共分离。这个费用是不菲的。按国内大多数地区的基因检测收费标准来计算，一个位点一个人500元，家系三人就是1500元，如果要验证10个位点就要1万5千元！但借助家系（Trios）模式，可直接精准找到致病突变，则可大幅降低患者的检测费用。
家系（Trios）模式有这么多好处，说它带来了遗传病诊断的革命也不为过。