智因新技术 丨 New Technology of Chigene
免疫组库测序是一种常用于评估各种免疫相关疾病和遗传性突变引起的免疫细胞中TCR/BCR基因重排碱基序列的技术,并评估各序列的丰度,用于研究不同免疫细胞克隆的转录情况和相互关系。
近期,智因东方免疫组库测序技术助力发现了特发性肾病综合征新致病机制,相关研究成果发表于学术期刊《World Journal ofPediatrics》。
研究解读
期刊:World Journal of Pediatrics
影响因子:9.18,JCR Q1
本研究由浙江大学医学院附属儿童医院的毛建华教授团队完成。研究者对10名特发性肾病综合征(INS)患儿(其中5名阳性和5名阴性的vinculin自身抗体),通过免疫组库测序(由智因东方完成)发现,治疗前后外周血中的TCR和BCR储备有显著的差异,揭示了T细胞和B细胞免疫在INS的发病机制中起着重要作用。
研究者首先通过比较治疗前后外周血中TRA(T细胞受体α)、TRG(T细胞受体γ)和IGH(免疫球蛋白重链)基因库中从稀有克隆型到高度丰富克隆型的比例,以及单个克隆型的大小变化,以评估淋巴细胞特征。
研究结果显示,INS患儿表现出高度丰富的克隆型,而对照组表现出较小的克隆型,尤其是TRA。在接受有效治疗后,克隆型的大小发生了明显的变化,特别是IGH,这表明B细胞免疫的失调参与了INS的发病机制。
随后, 研究者详细分析了vinculin自身抗体对IGH、TRA和TRG图谱的影响,发现治疗后,vinculin自身抗体阴性患者的TRA和TRG图谱多样性显著增加,而阳性患者的IGH图谱多样性则显著增加。
结果表明,T细胞和B细胞免疫机制不同,在vinculin自身抗体阳性患者中,B细胞起着重要作用,而T细胞免疫紊乱则在vinculin自身抗体阴性患者的发病机制中发挥作用。需要指出的是,vinculin在维持肾小球屏障完整性方面至关重要,其自身抗体与蛋白尿呈正相关。
除此之外,IGH V3.23、V3.21和J4、TRA V13.1和V3.21、TRG V9和J1几乎在所有样本中都表现出高频使用,这表明患者IGH、TRA和TRG基因库的V和J基因具有使用偏好性。同时,治疗前后V和J基因的使用没有显著差异,表明免疫抑制治疗没有改变V和J的使用频率。不过,这些高频V和J基因片段是否可以作为INS疾病监测的指标,有待进一步研究。
图 IGH(a)、TRA(b)和TRG(c)的V和J基因使用频率热图
总而言之,该研究明确了INS患者TCR和BCR的特点,揭示了T细胞和B细胞免疫对不同INS的发病机制。智因东方为本研究提供了重要的技术支持!